西伯利亚哈士奇犬可能会有以下几种不同的眼睛颜色：
在某些个体犬中，一只眼睛可能是棕色的，另一只是蓝色的（完全异色症），或者一只或两只眼睛可能是 “偏色 "的，即一半棕色一半蓝色（部分异色症）。所有这些眼色组合都被美国养犬俱乐部认为是可以接受的1
美国养犬俱乐部的西伯利亚哈士奇的品种标准（哈士奇西伯利亚犬的英文拼写）规定。
眼睛：杏仁形，间距适中，略微斜置。眼睛的颜色可以是棕色或蓝色；每种颜色都可以接受，或者是偏色。缺点–眼睛太斜；眼睛间距太近
因此，这个品种有几种眼睛颜色可以接受。
除了已经提到的，在成长的前几周，颜色也会发生变化。所以到了8周大的时候，小狗的颜色可能已经从蓝色变成了深色，比如棕色的阴影。
根据2018年10月4日公开获取期刊《PLOS Genetics》上发表的一项研究，Embark Veterinary公司的Adam Boyko和Aaron Sam's及其同事对6000多只狗进行的DNA测试显示，犬类18号染色体上的重复与西伯利亚哈士奇的蓝眼睛密切相关。" 正如文章中解释的那样，在他们测试的估计6000只狗中，所有的狗都有蓝眼睛。他们解释说，如果一只哈士奇没有蓝眼睛，那可能意味着基因没有正确转移，狗缺少18号染色体，这可能会导致狗的眼睛健康出现一些小到大的问题。其中一些问题可能是瞳孔周围视力模糊变色，甚至是一只眼睛失明，两只眼睛都有可能失明。基因变得混乱的方式是，持有眼睛颜色基因的公狗可能会有不同的健康问题，会导致一个帮助组装蛋白质的细胞缺失或虚弱。如果细胞缺失，持有眼睛颜色的基因就不能创造出使眼睛变蓝的所需细胞。这些健康问题通常与狗的胃有关。没有任何症状可以帮助主人知道是否存在这个问题。科学家和医生仍然不确定是什么原因导致了狗胃内的这些问题。如果你的哈士奇是母犬，你就不用担心这些问题，除非它的眼睛不是蓝色的。